MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 164482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002678	GAA	2	6	22054	22059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470351
502	NC_002678	GC	3	6	22095	22100	0 %	0 %	50 %	50 %	13470351
503	NC_002678	CGC	2	6	22164	22169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470351
504	NC_002678	GCCG	2	8	22219	22226	0 %	0 %	50 %	50 %	13470351
505	NC_002678	GAC	2	6	22228	22233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470351
506	NC_002678	GC	3	6	22246	22251	0 %	0 %	50 %	50 %	13470351
507	NC_002678	TCG	2	6	22256	22261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470351
508	NC_002678	CGC	2	6	22305	22310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470351
509	NC_002678	GCC	2	6	22315	22320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470351
510	NC_002678	ATC	2	6	22358	22363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470351
511	NC_002678	GGC	2	6	22366	22371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470351
512	NC_002678	GCC	2	6	22381	22386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470351
513	NC_002678	GC	3	6	22421	22426	0 %	0 %	50 %	50 %	13470351
514	NC_002678	TCG	2	6	22515	22520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470351
515	NC_002678	GCC	2	6	22531	22536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470351
516	NC_002678	TGA	2	6	22542	22547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470351
517	NC_002678	TCT	2	6	22548	22553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470351
518	NC_002678	GCC	2	6	22562	22567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470351
519	NC_002678	TGA	2	6	22602	22607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470351
520	NC_002678	CGG	2	6	22638	22643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470351
521	NC_002678	CGC	3	9	22877	22885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470352
522	NC_002678	GCA	2	6	22924	22929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470352
523	NC_002678	CGCCGG	2	12	22960	22971	0 %	0 %	50 %	50 %	13470352
524	NC_002678	GGT	2	6	22998	23003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470352
525	NC_002678	TCG	2	6	23025	23030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470352
526	NC_002678	GC	3	6	23044	23049	0 %	0 %	50 %	50 %	13470352
527	NC_002678	TGCC	2	8	23050	23057	0 %	25 %	25 %	50 %	13470352
528	NC_002678	ACG	2	6	23061	23066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470352
529	NC_002678	CGG	2	6	23113	23118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470352
530	NC_002678	CGG	2	6	23154	23159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470352
531	NC_002678	CCAGCG	2	12	23170	23181	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13470352
532	NC_002678	CAC	2	6	23204	23209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470352
533	NC_002678	ATGGCA	2	12	23223	23234	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13470352
534	NC_002678	CGG	2	6	23248	23253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470352
535	NC_002678	GCC	2	6	23277	23282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470352
536	NC_002678	CGG	3	9	23314	23322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470352
537	NC_002678	CGA	2	6	23398	23403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470352
538	NC_002678	CGAT	2	8	23418	23425	25 %	25 %	25 %	25 %	13470352
539	NC_002678	CGT	2	6	23444	23449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470352
540	NC_002678	CCG	2	6	23464	23469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470352
541	NC_002678	CGC	3	9	23527	23535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470352
542	NC_002678	CGC	2	6	23560	23565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470352
543	NC_002678	TGC	2	6	23575	23580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470352
544	NC_002678	CGC	3	9	23596	23604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470352
545	NC_002678	CGGC	2	8	23638	23645	0 %	0 %	50 %	50 %	13470352
546	NC_002678	GCC	2	6	23687	23692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470352
547	NC_002678	CGT	2	6	23770	23775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_002678	CGG	2	6	23802	23807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_002678	A	6	6	23870	23875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_002678	A	6	6	23935	23940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_002678	GAC	2	6	23982	23987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_002678	GCG	2	6	24067	24072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470353
553	NC_002678	GTC	2	6	24136	24141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470353
554	NC_002678	GCTC	2	8	24164	24171	0 %	25 %	25 %	50 %	13470353
555	NC_002678	CG	3	6	24206	24211	0 %	0 %	50 %	50 %	13470353
556	NC_002678	CAT	2	6	24216	24221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470353
557	NC_002678	GAC	2	6	24252	24257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470353
558	NC_002678	AGA	2	6	24287	24292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470353
559	NC_002678	GGC	2	6	24295	24300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470353
560	NC_002678	TCG	2	6	24311	24316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470353
561	NC_002678	CTG	2	6	24376	24381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470353
562	NC_002678	TGG	2	6	24458	24463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470353
563	NC_002678	CGC	2	6	24485	24490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470353
564	NC_002678	GC	3	6	24489	24494	0 %	0 %	50 %	50 %	13470353
565	NC_002678	TGA	2	6	24545	24550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470353
566	NC_002678	TCA	2	6	24608	24613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470353
567	NC_002678	GTTCG	2	10	24642	24651	0 %	40 %	40 %	20 %	13470353
568	NC_002678	CGG	2	6	24666	24671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470353
569	NC_002678	CCG	2	6	24711	24716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470353
570	NC_002678	CGA	2	6	24738	24743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470353
571	NC_002678	GGT	2	6	24771	24776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470353
572	NC_002678	GCC	2	6	24792	24797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470353
573	NC_002678	GGT	2	6	24804	24809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470353
574	NC_002678	CAT	2	6	24819	24824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470353
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576	NC_002678	GGC	2	6	25060	25065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470353
577	NC_002678	GAC	2	6	25066	25071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470353
578	NC_002678	CCG	2	6	25182	25187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_002678	CGG	2	6	25198	25203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_002678	CCG	2	6	25321	25326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_002678	CGG	2	6	25334	25339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_002678	GCA	2	6	25353	25358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_002678	AGG	2	6	25411	25416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470354
584	NC_002678	CG	3	6	25537	25542	0 %	0 %	50 %	50 %	13470354
585	NC_002678	CCA	2	6	25543	25548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470354
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587	NC_002678	CGG	2	6	25571	25576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
588	NC_002678	CG	3	6	25610	25615	0 %	0 %	50 %	50 %	13470354
589	NC_002678	CTT	2	6	25625	25630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470354
590	NC_002678	GC	3	6	25673	25678	0 %	0 %	50 %	50 %	13470354
591	NC_002678	GAA	2	6	25721	25726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470354
592	NC_002678	GCT	2	6	25733	25738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470354
593	NC_002678	GGC	2	6	25766	25771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
594	NC_002678	GAA	2	6	25781	25786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470354
595	NC_002678	CAT	2	6	25811	25816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470354
596	NC_002678	ATCG	2	8	25890	25897	25 %	25 %	25 %	25 %	13470354
597	NC_002678	GGGC	2	8	25913	25920	0 %	0 %	75 %	25 %	13470354
598	NC_002678	AGG	2	6	26002	26007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470354
599	NC_002678	TCGA	2	8	26031	26038	25 %	25 %	25 %	25 %	13470354
600	NC_002678	GCG	2	6	26127	26132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
601	NC_002678	TCC	2	6	26133	26138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470354
602	NC_002678	TCC	2	6	26208	26213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470354
603	NC_002678	CGAA	2	8	26242	26249	50 %	0 %	25 %	25 %	13470354
604	NC_002678	CAT	2	6	26273	26278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470354
605	NC_002678	GCGCC	2	10	26279	26288	0 %	0 %	40 %	60 %	13470354
606	NC_002678	GCT	2	6	26303	26308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470354
607	NC_002678	GCT	2	6	26381	26386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470354
608	NC_002678	GCG	2	6	26389	26394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
609	NC_002678	CGGCCT	2	12	26456	26467	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13470354
610	NC_002678	AGC	2	6	26629	26634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470354
611	NC_002678	GC	3	6	26646	26651	0 %	0 %	50 %	50 %	13470354
612	NC_002678	GCC	2	6	26676	26681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470354
613	NC_002678	GCAG	2	8	26750	26757	25 %	0 %	50 %	25 %	13470354
614	NC_002678	GGT	2	6	26828	26833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470354
615	NC_002678	CGG	2	6	26864	26869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
616	NC_002678	CAT	2	6	26888	26893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470354
617	NC_002678	TCGA	2	8	26910	26917	25 %	25 %	25 %	25 %	13470354
618	NC_002678	AGA	2	6	26932	26937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470354
619	NC_002678	TGC	2	6	26996	27001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470354
620	NC_002678	GC	3	6	27024	27029	0 %	0 %	50 %	50 %	13470354
621	NC_002678	CA	3	6	27157	27162	50 %	0 %	0 %	50 %	13470354
622	NC_002678	GAG	2	6	27180	27185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470354
623	NC_002678	TCG	2	6	27217	27222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470354
624	NC_002678	GTCG	2	8	27254	27261	0 %	25 %	50 %	25 %	13470354
625	NC_002678	CGA	2	6	27311	27316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470354
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627	NC_002678	GCG	2	6	27388	27393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
628	NC_002678	CGT	2	6	27434	27439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470354
629	NC_002678	CGC	2	6	27455	27460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470354
630	NC_002678	GGC	2	6	27494	27499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
631	NC_002678	CGA	2	6	27512	27517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470354
632	NC_002678	GGC	4	12	27536	27547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
633	NC_002678	CGCC	2	8	27562	27569	0 %	0 %	25 %	75 %	13470354
634	NC_002678	AAG	2	6	27609	27614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470354
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638	NC_002678	GCTC	2	8	27781	27788	0 %	25 %	25 %	50 %	13470354
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643	NC_002678	CGA	2	6	27857	27862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470354
644	NC_002678	TCG	2	6	27865	27870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470354
645	NC_002678	CCG	2	6	27907	27912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470354
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647	NC_002678	GGCG	2	8	27933	27940	0 %	0 %	75 %	25 %	13470354
648	NC_002678	CGG	2	6	27959	27964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
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661	NC_002678	TTGC	2	8	28339	28346	0 %	50 %	25 %	25 %	13470355
662	NC_002678	GGCGC	2	10	28362	28371	0 %	0 %	60 %	40 %	13470355
663	NC_002678	CG	3	6	28471	28476	0 %	0 %	50 %	50 %	13470356
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665	NC_002678	CGGCG	2	10	28553	28562	0 %	0 %	60 %	40 %	13470356
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669	NC_002678	TCG	2	6	28824	28829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470356
670	NC_002678	CGG	2	6	28936	28941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470356
671	NC_002678	TCC	2	6	28983	28988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470356
672	NC_002678	CG	3	6	28998	29003	0 %	0 %	50 %	50 %	13470356
673	NC_002678	TTCGCT	2	12	29065	29076	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
674	NC_002678	A	6	6	29082	29087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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679	NC_002678	CGGCTT	2	12	29429	29440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470357
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683	NC_002678	CCA	2	6	29585	29590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470357
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747	NC_002678	CATGG	2	10	32527	32536	20 %	20 %	40 %	20 %	13470359
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752	NC_002678	CCGG	2	8	32817	32824	0 %	0 %	50 %	50 %	13470359
753	NC_002678	GAA	2	6	32829	32834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470359
754	NC_002678	GC	3	6	32856	32861	0 %	0 %	50 %	50 %	13470359
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758	NC_002678	CG	3	6	32951	32956	0 %	0 %	50 %	50 %	13470359
759	NC_002678	GAT	2	6	32974	32979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470359
760	NC_002678	GGC	2	6	32984	32989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470359
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